这家成都“明日之星”，如何用AI重构多肽药物研发？
Deepseek爆火颠覆千行百业，也重塑了AI制药的逻辑，其不仅极大加快了AI药物开发的过程，还大幅降低了应用AI技术的成本，有望推动AI技术成为药物开发标配。在DeepSeek加持下，生物医药产业势必迎来一波AI制药创新创业潮，行业对药物候选数据库的需求将显著增加。
药物候选数据库正在成为AI制药行业的战略资源，而成都早已抢占先机，围绕药物候选数据库构建中试平台，譬如小分子数据库方面，依托成都先导搭建了小分子创新药智能化中试研发平台，多肽数据库方面，依托佩德生物搭建了动物毒液多肽中试平台。活用中试平台，成都生物医药产业“企业满园”必将水到渠成。
AI制药颠覆传统制药，DeepSeek颠覆AI制药
传统制药的流程一般是靶点发现、化合物筛选、临床前研究、临床试验、审批上市，这个过程需要10～15年，成本高达数十亿美元，成功率却很低。而AI制药则利用AI技术大幅缩短上述步骤花费的时间。
图1. AI制药发展历史
AI技术理论从1990年便大规模发展，但直到201年后AI制药才开始崭露头角。2020年左右，DeepMind建立的AlphaFold平台成功解决蛋白质空间结构预测难题，同时英矽智能开发出全球首个由AI发现的具有全新靶点和全新分子结构的候选化合物ISM001-055，将分子发现时间由传统制药的2年降至11个月，总费用从4.14亿美元降低至20万美元。
由此，药企们看见了AI制药颠覆传统制药的可能，大批企业开始涌入。
据蛋壳研究院《2024年医疗人工智能报告》显示，2021年后由AI主导的创新药进入临床试验数量开始呈倍式增长，从此前的个位数飙升至百位数。
阿斯利康、拜耳、罗氏、礼来和赛诺菲等MNC相继入局AI制药。美国和欧洲生物医药AI领域的2024年投资总额达到56亿美元，比2021年（36亿美元）高出约20亿美元，是2023年（18亿美元）的3倍多。
2025年初，DeepSeek横空出世，又颠覆了成型于2020—2024年间的“传统”AI制药，极大促进了AI技术在药物研发中的应用。
越来越多的中国药企寄望DeepSeek助力药物研发。
例如，海正药业为推进人工智能在药物研发阶段的应用落地，已将DeepSeek-R1模型接入其HisunAI，还希望与AI制药公司合作突破新药研发技术壁垒。
复星医药在内部发布了自主研发的PharmAID决策智能体平台，通过整合DeepSeek-R1模型，将靶点筛选周期从18个月缩短至4个月。
恒瑞医药决定在全公司范围内开展DeepSeek应用工作，将DeepSeek应用情况作为各级干部年度工作考核的重要指标之一，助力突破新药研发技术壁垒，提升药物研发效率，加速科研成果转化。
DeepSeek还通过大幅降低药企应用AI技术的成本，改变由大企业垄断AI制药技术的现状。业内专家指出，DeepSeek凭借开源和成本优势，降低了企业们使用AI技术的门槛，很多药企愿意通过API调用的方式尝试，这打破了过去只有大公司能够使用AI的壁垒，让更多公司和个人更易接触和使用AI技术。
成本大幅降低，将使AI技术成为每一家创新药企标配，叠加针对创新药的医保新政策利好，AI药企有望如雨后春笋般涌现。
天然分子药物候选库成为AI药企首选
DeepSeek暂时还无法直接用于靶点的发现、分子的生成，不过潜力很大，不少企业在做相关探索。佩德生物董事长容明强教授告诉成都硬科技企业联盟，目前DeepSeek可以赋能药物临床阶段的研发，比如提高撰写临床试验报告效率等，在药物发现阶段，大部分药企仍在使用垂类模型。
但不管使用垂类模型还是DeepSeek，随着AI制药“蛋糕”越做越大，行业对药物候选库的需求也越来越旺盛，一方面AI药企需要大量优质数据训练模型，另一方面，AI药企更倾向采用天然分子库筛选药物，而非由AI全新生成药物分子。
天然产物是新药发现的重要源泉，尤其在抗肿瘤药物领域，天然产物具有更加重要的地位。据统计，1940—2014年，美国FDA共批准246个新化学实体（NCE，通常指以前没有被用于治疗疾病的药物产品）作为抗肿瘤药物，其中基于天然产物的药物占总数的83%。
虽然AI技术能设计出在大自然中不存在药物分子，但AI制药仍处于早期阶段，大多数AI设计的药物分子尚未进入临床试验阶段，其安全性和有效性有待验证。容明强教授指出，目前AI制药大部分进入临床的管线都属于由AI技术筛选的天然分子，完全由AI生成的分子少之又少。
同时，随着药企普遍涉足AI制药，新药开发周期整体将大幅缩短，研发管线数量成倍增长，临床试验与行政审批资源有限，对AI制药管线的审批预计将变得越来越严。从历史经验看，基于天然产物的AI药物要比纯AI生成的药物更能获得审批方面的优势，隐性成本更低，因此更受AI药企青睐。
佩德生物从2022年便开始建立天然多肽分子库，吸引来自天然活性多肽国家地方联合工程研究中心（中科院昆明动物所）、动物多肽药物创制国家地方联合工程研究实验室（湖南师范大学）两个国家级平台的高端人才，建成了全球最大的、物种资源覆盖最全面的、高活性多肽最多的动物毒液多肽库，库中采集了近3000个物种，多肽序列超过1.3亿条，高质量多肽实体库超过1万个。
图2. 依托动物毒液多肽库开发多肽药物流程
佩德生物技术研发路线的灵感来源于国家发明技术二等奖的BT+IT结合多肽开发技术，自研与合作开发十余个药物管线，其中已有一条管线获得IND批件并进入临床阶段，初步验证了采用AI技术发现全新靶点并从天然多肽分子库中筛选药物开发的可行性。
后续佩德生物计划依托天然多肽分子库赋能更多AI制药企业，以促进多肽药物行业的快速发展，预计可帮助AI药企进一步将药物前期开发时间从近一年缩短至数月。
成都依托中试平台促进“企业满园”
“多肽药物比蛋白质药物稳定，但比小分子药物易分解。不谈数据存储成本，单说维持一定规模的多肽实体样本库，开支就不小。佩德能够维持天然多肽分子库并进一步做大做强，离不开成都的大力支持，”容明强教授感叹。
在成都高新区的支持下，佩德生物依托天然多肽分子库搭建了动物毒液多肽中试平台，并于去年底通过公示，进入实质运营阶段。
该中试平台位于天府国际生物城，专注于依托亿级数据规模的动物毒液多肽库开发多肽创新药，通过规模化采集全国各地拥有丰富的野生动物资源，为多肽研究提供丰富的毒液样本，并挖掘各类毒液中的多种高活性多肽，有力支持新型药物的研究和开发。
图3. 佩德动物毒液多肽中试平台
中试平台作为促进科技创新和成果转化的“关键要素”，正在成为成都践行“立园满园”行动的重要抓手。
早在2022年，成都高新区率先开展实施“中试跨越行动计划”，打造全国科技成果中试的首选地。2024年，随着工信部、国家发改委联合印发《制造业中试创新发展实施意见》，中试平台建设在成都全面开花，6个省级、69个市级中试平台和概念验证中心全面运行，服务成果转化项目超2000个，全国首单中试平台知识产权资产证券化产品在蓉发行。
2025年成都市政府报告进一步提出，构建综合性、专业化的中试服务体系，打造“中试+”成果转化服务生态，建强西部中试综合服务平台，新建中试平台和概念验证中心40个以上。
前不久，《成都市建设西部中试中心实施方案》正式发布，该方案围绕“建设中试平台、提升中试服务、完善中试生态、塑造中试品牌”等核心内容，提出了12项具体任务。这些举措旨在推动成都打造西部地区的中试中心，进一步加速科技成果的转化与应用。
“成都多肽药物制造能力很强，但做多肽原研药的企业不多。政府希望通过我们中试平台，吸引一批做多肽创新药企在成都聚集，助力实现‘企业满园’，目前已取得了一定成效，”容明强教授表示，“站在做企业的立场，我们还希望在不久的将来，佩德生物能快速成长为天府国际生物城的‘镇园之宝’！”
（来源：科技信息网）
